故事发生在风景秀丽的密西西比河畔，汤姆（乔纳森·泰勒·托马斯 Jonathan Taylor Thomas 饰）自幼丧母，是一个身世可怜的孤儿。然而，在朋友和亲戚们的帮助和扶持下，汤姆还是成长为了一个快乐勇敢的男孩。哈克贝利（布拉德·兰弗洛 Brad Renfro 饰）是汤姆最好的朋友，两个孩子在一起，常常惹出各种各样的麻烦，闹了数不清的笑话。
一次偶然中，汤姆竟然成为了一宗凶杀案的目击证人，由于害怕遭到凶手的报复，汤姆和哈克贝利决定离家出走，踏上逃亡的旅途。汤姆的失踪让亲人倍感焦急，可他却在孤岛上开辟了自己的小天地，过得逍遥快活。最终，在案件即将审判之时，汤姆站了出来说出了真相，帮助法官做出了公正的判决。